三年前的《猩球崛起》,以一场病毒大爆发作为悬念结尾,此次续集便从大毁灭之后的故事展开。人类经历病毒肆虐几乎灭绝,一小部分幸存者生活在旧金山。相反,在第一集中具有了高智商的猿族首领凯撒,则领导猩猩们建立起自己的王国。人类为了维修山上仅存的发电站,无意中闯入了猩猩的世界,激发了两个不同种族之间的生存危机。这一集的主题,也不再是反思人类对科技的滥用,而是强调对种族问题的思考,这使得全片更像是一个关于现实人类社会的寓言。第一集中的主角凯撒,此时更像是一个怀揣理想主义的君王。他想要建立猿类的和平家园,但最后却意识到,猩猩同人类一样,也会因仇恨和利令智昏而自相残杀。夹在不同种族之间的凯撒,表现出无奈与悲情。