【图】名侦探柯南好看吗？ 柯南带你走进冒险之旅

漫画Vol.57 File.8《逃亡者》未改编为正式TV版情节，仅和OP 23中的故事相似，后改编为M 18公映纪念特辑《逃亡者 毛利小五郎》（NOTTV手机电视台播出）和2015新年特辑《谨贺新年·毛利小五郎》。
因为涉及版权问题，漫画“口哨男连续杀人案”中犯人所吹的披头士乐队《Let it be》的名字，在动画533~535集台词中被完全隐去。类似地还有“奥斯卡奖”改为“粤斯卡奖”，iPhone的商标被改动。
动画第585集中，出现了“二学期”字样，表示柯南已经升入一年级第二学期（注意不是二年级，而且日本的学校一年有三个学期）。漫画中至今未出现过类似情节和叙述。
考虑到观看动画的主体是未成年人，动画中死者的血液均改为黑色而非红色。在中后期部分动画中，将死者的眼睛 
由原作中的睁着改为闭着，不会对死者面部进行特写，之前还有尖叫警告，“尸体”一词也改用比较中性的“遗体”一词来代替。（前期部分集数已出现此现象，但后期更普遍。同时期《金田一少年之事件簿》也开始限制对尸体的描写）
动画中也修改了部分不恰当的“裙底走光”描写，“色情男”被改称“浮气男”，在第230集中也删掉了漫画中暗示琴酒与贝尔摩德有过肉体关系的暧昧对话。

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