1994年参演高志森监制的电影《蜜桃成熟时》,票房高达1200万;同年主演的《爱的精灵》《不扣钮的女孩》上映,李丽珍将事业重心由影视转到歌唱方面发展;同年与艺能动音签约,推出首张国语唱片《纯真》。1996年淡出娱乐圈,后于1998年复出娱乐圈。1999年与黄秋生主演了电影《千言万语》,凭借该作品她获得了第36届台湾电影金马奖最佳女主角奖。2002年与内地演员陈龙在主演了邓建国执导的电影《母亲快乐》,她在影片中担任女主角“郭辛丽”。2003年与盖克联袂出演悲剧故事片《妈妈别走》,她在影片中饰演“丁淑芬”。2004年出演电影《母夜叉与花魁女》。2005年参演内地电视剧《仙剑奇侠传》,与胡歌、刘亦菲、安以轩合作,李丽珍在剧中饰演“圣姑”。