1999年萧亚轩发行首张专辑《萧亚轩同名专辑》在中国台湾销售超过50万张,是1999年台湾唱片销量冠军;同年,elva在EMI全球的年度大会上,取代了宇多田,成为“销售冠军新秀”。2000年萧亚轩发行第二张专辑《红蔷薇》并于8月26日在台湾台北市立体育场举办个人第一场售票演唱会“夏日蔷薇演唱会”。 凭借两张专辑,萧亚轩成为由IFPI认证(1999-2000)全球华语唱片最高销量歌手并获得1999年至2000年度世界音乐大奖(The World Music Awards)“全球年度销售最佳华语歌手”。2001年萧亚轩发行第三张专辑《明天》,并在香港红磡体育馆举办两场“夏日的精彩”演唱会。成为继张惠妹后,第二位登上红磡体育馆举办演唱会的中国台湾女歌手。同时她还担任潘婷洗发水大中华地区代言人。2002年萧亚轩发行了第四张专辑《4U》和第五张专辑《爱的主打歌·吻》并于8月30和31日连续在香港红磡体育馆举办两场“闪耀萧亚轩”演唱会,并成为雪碧饮料大中华地区代言人。