大学时,母亲为燕姿报名李伟菘音乐学校,开始学习唱歌,担任校园乐队主唱,碰巧当时即将上任华纳音乐董事长的周建辉到访李伟菘音乐学校,李伟菘安排数位表现较好的学员唱歌,孙燕姿独特的的嗓音和扎实的音乐功底引起华纳制作人的关注,表示要签约,但由于孙燕姿的父亲坚持要女儿完成学业后才签约,于是唱片公司决定等她两年,在2000年她才正式签约华纳唱片公司。
2002年,孙燕姿发行第四张专辑《Start自选集》,在这张专辑中,她翻唱披头士的《hey jude》、多莉·艾莫丝的《silent all these years》、艾拉妮丝·莫莉塞特的《that i would be good》、荷兰女子乐队shocking blue的70年代经典名曲《venus》、美国“朋克教母”帕蒂·史密斯(Patti Smith)的名作《Sometimes Love Just Ain‘t Enough》、齐豫的《橄榄树》、王菲的《天空》、张惠妹的《原来你什么都不想要》、莫文蔚的《没时间》,还有自己出道前的第一首词曲创作《Someone》;5月,发行第五张专辑《Leave》。在台湾2002年度专辑销售榜上,《Start自选集》获得第二,《leave》第四。