2008年,林丹因很早就锁定了一个奥运参赛资格,不必为奥运积分赛牵扯过多精力。所以赛季初的林丹显得较为慢热,首先放弃参加了马来西亚公开赛。1月30日,在韩国羽毛球公开赛男子单打决赛中以1:2输给了韩国选手李炫一,在这场比赛中林丹先以21-4轻松拿下首局,后被李炫一逆转。而在比赛临近结束时林丹还与韩国队的中国籍教练李矛发生了口角上的摩擦,并被出示黄牌警告。3月9日,在英国伯明翰举行的全英羽毛球公开赛男单决赛中,林丹0:2完败陈金,获得亚军。3月16日,状态有所调整的林丹在瑞士公开赛男子单打决赛中以2:0击败老对手马来西亚选手李宗伟折桂。5月18日,在印尼雅加达举办的汤姆斯杯上,决赛中林丹对阵韩国队的朴成奂,在先失一局的不利情况下连扳两局2:1战胜对手,最终帮助中国队中国男队以3比1力克韩国队,第二度蝉联该项赛事。