在他三十岁的时候,老母患严重的脾病。他心情焦急,请了许多医生治疗都治不好。原来这些医生,大都医术粗劣,受当时社会风气影响,盲目搬用《局方》。开的药大同小异,吃下去一点效果也没有。这时,他深深体会到:“医者,儒家格物致知一事,养亲不可缺”(《格致余论》序)。于是他立志学医,日夜攻读《素问》。以前,他也曾读过《素问》,觉得“词简而义深,去古渐远,衍文错简”,然后“茫若望洋,淡如嚼蜡”。
有一次上头要求村民们交税,朱丹溪只报上了两家,上头问他:“你的地盘就交上这么一点包银,不想要脑袋了?” 朱丹溪说:“脑袋一定要,但是百姓比脑袋更重要。”转眼朱丹溪到三十而立的年纪了,朱丹溪的妈妈却突然病倒了,于是朱丹溪便辞掉了官职,转学医术。说起医学朱丹溪是有点底子的,朱丹溪在家里自己琢磨了五年,竟然把妈妈的病治好了,一年后朱丹溪便开始登门拜访名医,他偶然得知医学大师罗知悌就隐居在杭州附近山林之中,朱丹溪赶紧登门拜访。朱丹溪拜罗知悌为师以后,因为勤奋好学,加上罗知悌认真传教,不久朱丹溪的医术已经和罗知悌旗鼓相当了。