2008-2009赛季初始,湖人就以一波7连胜开局。科比带领球队打出平队史纪录的最佳开赛战绩17-2, 到12月中旬,湖人队的成绩为21-3。 科比连续第11次入选全明星赛首发阵容,而且一直是最有价值球员奖项的最有力竞争者。 科比在12月和1月均荣膺西部月最佳球员,并且三次获得西部周最佳球员。2009年2月2日在一场与纽约尼克斯队的比赛中,科比拿到61分,创造了麦迪逊广场花园球馆的最高得分纪录。在2009年NBA全明星赛上,科比拿到27分,4次助攻,4个篮板和4次抢断,与前队友奥尼尔一同分享了全明星赛MVP奖杯。湖人队在常规赛拿到了西部最佳的65-17的成绩。科比在MVP的投票评选中仅次于勒布朗·詹姆斯(LeBron James)排名第二,并且职业生涯第七次入选NBA最佳阵容第一阵容以及NBA最佳防守阵容第一阵容。