2000年左右,王祖贤和齐秦已经到了谈婚论嫁的地步。正当他们准备结婚的时候,却爆出齐秦有个私生子。2001年8月,齐秦的前女友方美芳以儿子方伟的名义将齐秦告上法庭,并索要抚养费1500万元台币。齐秦在服兵役的时候和方美芳在一起,只不过后来齐秦越来越红,两人分手之后,方美芳才发现有了齐秦的孩子。
被官司一闹,王祖贤已经没有结婚的心思了。2001年10月,在齐秦不知情的情况下,王祖贤宣布退出影视圈,远赴国外留学。
据传,王祖贤现在有个小男友,比她小19岁。王祖先在加拿大重返校园,在一间国际语言学校读书,期间和1名男同学谱出恋曲。