韦小宝(陈小春饰)刁钻聪敏,自小随母居扬州妓院,因偶然知悉宫中秘密,被迫冒充小太监留在宫中。后助少年皇帝康熙(马浚伟饰)消灭奸臣成莫逆之交。宝更误打误撞得天地会总舵主暗中收为弟子,要他伺机剌杀康,令宝感左右为难。
宝无意得悉神龙教派人假扮太后潜服宫中十多年,企图盗取大清命脉藏宝图,真太后则被囚禁,康遂联合宝,几经艰险,救出太后。另一方面,宝惊悉老皇帝顺治仍健在,往拜见途中,巧遇少女阿珂(梁小冰饰),神魂颠倒。宝施妙计令康父子团聚,又挑拨神龙教人自相残杀,再建一功。
宝衣锦还乡,重遇阿珂,辗转更得七女同时下嫁,尽享齐人之福。不久,江山大统,康命宝消灭天地会,宝始知康早洞悉自己的秘密。
公元一六六一年,顺治帝驾崩,太监海大富为了要追查荣亲王、董鄂妃、孝康皇后及贞妃的死因,在宫中一查便查了十年,终於得知关键人物太监陈文亮正避藏在扬州,便带同小桂子到扬州,寻找陈公公。韦春花出身青楼女子,与儿子韦小宝相依为命,小宝聪明伶俐,但为人口甜舌滑,乃市井之徒,和丽春院的倒水杂役陈光臭味相投。陈光见海公公来到扬州,心知不妙,连夜离开,还着小宝替他取回小木盒,海公公见小木盒,要胁小宝带他往找陈光,原来陈光就是陈文亮。
陈光向海公公说出当年宫中所发生的冤案,海公公强迫他回宫作证,但陈光宁死都不再回宫。双儿为了替义父陈光还债,被丽春院逼良为娼,幸得庄家叁少奶收为婢女,偿还债务。吴之荣因为贪赃枉法被革职,一日到庄家想谋取私利,但庄老爷只赠予湖州三宝-蚕丝、毛笔及《明书辑略》。吴之荣得不到好处,发现《明书》中仍采用明崇祯年号,为了恢复官位不惜诬陷为反书。