后来,在吴君如的鼓励下,陈可辛创立了电影公司,2002年底,陈可辛请吴君如加盟电影《金鸡》,扮演女主角阿金。有一天晚上,陈可辛和吴君如来到一家茶馆,一个花枝招展的女子走过来,一把揽住陈可辛﹕“大导演,你好长时间不来看人家了,人家想死你了……”陈可辛一脸尴尬,还没来得及解释,吴君如就爆发了,她端起茶杯泼了陈可辛一身,转身冲出茶馆。后来,陈可辛去找吴君如解释,那个女子是演员,几乎看见每一个导演都口头禅“想死你了”,但吴君如心中芥蒂依然难以消除。在《金鸡》拍摄期间,陈可辛凡事都对吴君如百般体贴,可她总是不领情。陈可辛知道,要得到她的原谅,只能帮助她演好“阿金”这个角色。于是,他一次次地板着脸要她重演,经过无数次重演,吴君如渐入佳境。
同居后,两人因性格差异极大,经常发生争吵。每当发生口角时,陈可辛总要哄她消消火气,待吴君如恢复平静后,陈可辛才认错。经过一年多的磨合,两人再不会为一些无聊的小事吵架。2006年4月10日,两人的女儿出生,但是二人还是没有结婚。