1930年,日军为即将发动的侵华战争准备,日本科学家坂本稻一(朱瑞祥饰)在哈尔滨研制生化武器,这个秘密被哈尔滨独立旅上尉军医官冷风(王雷饰)发现,冷风担心鼠疫在哈尔滨扩散传播,向旅长张大炮(石兆琪饰)及当地政府首脑汇报,但张大炮和市长钱秉文(徐程饰)却为了自己的利益隐瞒疫情想把事件控制下来,冷风无奈,只得联合独立旅守卫队长七条(王志刚饰)一起暗中调查,但他不知道七条是共产党潜伏在独立旅的党员。冷风和黑七的调查引来了日本黑龙会的警觉,黑龙会头号杀手山口(木幡龙饰)奉命对冷风及接触过鼠疫患者的人员进行剿杀,但却发现冷家在哈尔滨财大气粗根本无法与之抗衡,最重要的是冷风还有一个在哈尔滨江湖上呼风唤雨撒豆成兵的弟弟冷动(刘欢饰),于是,紧急抽调黑龙会间谍稚子(徐露饰)以米拉的化名进入哈尔滨协助山口。与此同时,苏联担心在远东利益受到影响,派出情报官员何三关(涂松岩饰)以中东铁路局董事为由进入哈尔滨调查此事,就这样,几方势力围绕着鼠疫在哈尔滨开始掀起血雨腥风。