1979年,邓超出生在一个重新组合的家庭。上小学时,邓超练习过跳远、短跑、跳高,并且多次在“苗苗杯”小学生体育比赛中获得冠军。初中时,邓超变成了个叛逆少年,酷爱跳舞且因为年少轻狂,换了好几所学校,但最后被父母心感动,浪子回头。
1995年考入江西艺术职业学院95级话剧班,受到了三年正规的“学院派”话剧表演基本训练,还结识了导他走向正途的恩师邓学东老师。1998年考上中央戏剧学院表演系98级本科班,来到北京。每天清晨在中戏的校园跑步和练台词,训练标准的台词发音。大学二年级起,邓超喜欢上演话剧,不但在学校的表演作业里训练演出大量的角色,传统正剧他能演,创新喜剧他也能演,此外他还是班上人缘很好的“开心果”。2001年,大三的邓超与同学合作演出贺岁的话剧《翠花上酸菜》成为他学生时代的成名作。上大学时,他还被中戏的同学称为“戏疯子”。2002年,邓超在中央戏剧学院毕业,获得大学学士学位。